Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P20040 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms