Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NefhP19246 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NefhP19246 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms