Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifrd1P19182 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifrd1P19182 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms