Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms