Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18530 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms