Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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