Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms