Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms