Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P10404 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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