Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PolP10400 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PolP10400 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PolP10400 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PolP10400 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PolP10400 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PolP10400 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms