Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms