Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TtrP07309 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TtrP07309 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TtrP07309 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TtrP07309 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TtrP07309 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TtrP07309 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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TtrP07309 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TtrP07309 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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