Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mtatp6P00848 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mtatp6P00848 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms