Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms