Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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