Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Slc27a2O35488 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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