Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih2O35089 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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