Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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