Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms