Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms