Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms