Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms