Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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