Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms