Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms