Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Taf4bG5E8Z2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Taf4bG5E8Z2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Taf4bG5E8Z2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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