Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn20G5E8X0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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