Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm8005F6YKY3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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