Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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