Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atad2bE9Q166 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms