Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms