Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms