Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms