Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms