Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cttnbp2B9EJA2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cttnbp2B9EJA2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms