Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms