Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms