Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms