Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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