Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Scml2B1AVB3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Scml2B1AVB3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms