Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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