Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spocd1B1ASB6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spocd1B1ASB6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms