Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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