Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms