Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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