Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms