Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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