Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms