Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms