Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cib1Q9Z0F4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cib1Q9Z0F4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cib1Q9Z0F4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms